Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0C1

Rnf115, E3 ubiquitin-protein ligase RNF115, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf115Q9D0C1 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms