Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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