Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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