Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms