Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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