Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms