Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rpa3Q9CQ71 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rpa3Q9CQ71 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rpa3Q9CQ71 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rpa3Q9CQ71 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rpa3Q9CQ71 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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