Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Chmp3Q9CQ10 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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