Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms