Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms