Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms