Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms