Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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