Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms