Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CsprsQ99388 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms