Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Cldn16Q925N4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Cldn16Q925N4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Cldn16Q925N4 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Cldn16Q925N4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Cldn16Q925N4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
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Cldn16Q925N4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
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