Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms