Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf6Q91YR7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf6Q91YR7 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf6Q91YR7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf6Q91YR7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf6Q91YR7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf6Q91YR7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf6Q91YR7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf6Q91YR7 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf6Q91YR7 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf6Q91YR7 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf6Q91YR7 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf6Q91YR7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf6Q91YR7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf6Q91YR7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf6Q91YR7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf6Q91YR7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf6Q91YR7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf6Q91YR7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf6Q91YR7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf6Q91YR7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf6Q91YR7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf6Q91YR7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf6Q91YR7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf6Q91YR7 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf6Q91YR7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms