Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8952-201ENSMUST00000206828 1102 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppargc1bQ8VHJ7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms