Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Hoxc12Q8K5B8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Hoxc12Q8K5B8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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