Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms