Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rab11fip3Q8CHD8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rab11fip3Q8CHD8 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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