Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Ercc8Q8CFD5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ercc8Q8CFD5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ercc8Q8CFD5 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ercc8Q8CFD5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ercc8Q8CFD5 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ercc8Q8CFD5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Ercc8Q8CFD5 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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