Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snx8Q8CFD4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms