Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp27Q8CEG8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp27Q8CEG8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp27Q8CEG8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp27Q8CEG8 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp27Q8CEG8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp27Q8CEG8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp27Q8CEG8 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp27Q8CEG8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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