Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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