Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4aQ8C9S8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms