Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms