Protein–RNA interactions for Protein: Q8C156

Ncaph, Condensin complex subunit 2, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcaphQ8C156 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms