Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Atg16l1Q8C0J2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Atg16l1Q8C0J2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Atg16l1Q8C0J2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Atg16l1Q8C0J2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Atg16l1Q8C0J2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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