Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trerf1Q8BXJ2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trerf1Q8BXJ2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trerf1Q8BXJ2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trerf1Q8BXJ2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trerf1Q8BXJ2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trerf1Q8BXJ2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trerf1Q8BXJ2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trerf1Q8BXJ2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trerf1Q8BXJ2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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