Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms