Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Pggt1bQ8BUY9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Pggt1bQ8BUY9 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Pggt1bQ8BUY9 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Pggt1bQ8BUY9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms