Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q8BGC1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8BGC1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms