Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M10.5Q85ZW7 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M10.5Q85ZW7 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M10.5Q85ZW7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms