Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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