Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms