Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Zbtb40Q6PCS8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Zbtb40Q6PCS8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Zbtb40Q6PCS8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Zbtb40Q6PCS8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Zbtb40Q6PCS8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Zbtb40Q6PCS8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Zbtb40Q6PCS8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms