Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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