Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms