Protein–RNA interactions for Protein: Q62245

Sos1, Son of sevenless homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sos1Q62245 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sos1Q62245 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sos1Q62245 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Sos1Q62245 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Sos1Q62245 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Sos1Q62245 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Sos1Q62245 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Sos1Q62245 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Sos1Q62245 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Sos1Q62245 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sos1Q62245 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sos1Q62245 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sos1Q62245 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sos1Q62245 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sos1Q62245 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sos1Q62245 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sos1Q62245 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sos1Q62245 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms