Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ctr9Q62018 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ctr9Q62018 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ctr9Q62018 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ctr9Q62018 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ctr9Q62018 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctr9Q62018 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctr9Q62018 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctr9Q62018 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctr9Q62018 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctr9Q62018 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctr9Q62018 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctr9Q62018 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctr9Q62018 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctr9Q62018 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctr9Q62018 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctr9Q62018 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctr9Q62018 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctr9Q62018 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ctr9Q62018 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctr9Q62018 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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