Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ccne1Q61457 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms