Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf1Q61069 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms