Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms