Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms