Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

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Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Slc5a6Q5U4D8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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Slc5a6Q5U4D8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc5a6Q5U4D8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms