Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
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Trappc1Q5NCF2 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
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Trappc1Q5NCF2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
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Trappc1Q5NCF2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
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Trappc1Q5NCF2 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
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