Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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