Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpjQ569L8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms